首先，通过两个案例分析两种技术之间的细微差异：

案例一参考文献：A single-cell and single-nucleus RNA-Seq toolbox for fresh and frozen human tumors，发表期刊：Nature Medicine（IF58）。研究材料：人肿瘤组织。应用技术：scRNA-seq和snRNA-seq。在神经母细胞瘤的研究中，scRNA-seq检出了更多的免疫细胞，如T细胞、B细胞和NK细胞，而snRNA-seq则更多地检测到了实质性细胞，如神经嵴和神经内分泌细胞，但免疫细胞的检出显著降低，甚至未被检测到。在乳腺癌转移样本中，scRNA-seq和snRNA-seq的结果与上述结果基本一致，尽管两者在UMAP图中的重合度良好，各个聚类都有检测到，比例差异较大。

案例二参考文献：A pan-grass transcriptome reveals patterns of cellular divergence in crops，发表期刊：Nature（IF505）。研究材料：泛草。应用技术：scRNA-seq和snRNA-seq。两者都能有效反映完整组织的表达模式，相关性系数r≥0.7，并且特异基因的表达模式基本一致。作者比较了scRNA-seq和snRNA-seq的数据差异，指出在泛草样本中，scRNA-seq检测到的转录本和基因数量更多，而snRNA-seq因未经过组织解离，其GO结果在应激反应上较低。同时，在玉米的snRNA-seq细胞图谱中发现了新的细胞亚群。最终，作者总结认为这两种技术能够优势互补，联合分析将发挥更大的技术优势。

接下来，通过两个案例展示这两种技术的优势互补以及其潜在的强大能力：

案例三参考文献：Cells of the adult human heart，发表期刊：Nature（IF505）。研究材料：人心脏。应用技术：scRNA-seq和snRNA-seq。这项研究通过联合scRNA-seq和snRNA-seq获得了完整的人心脏细胞图谱，强调了心肌细胞、周边细胞和成纤维细胞的细胞异质性，揭示了不同发育起源和特性的心房和心室细胞亚群，提升了对人类心脏的理解，为未来研究提供了宝贵的参考。

案例四参考文献：Single-cell multi-omic and spatial profiling of human kidneys implicates the fibrotic microenvironment in kidney disease progression，发表期刊：Nature Genetics（IF317）。研究材料：人肾脏。应用技术：scRNA-seq、snRNA-seq、scATAC-seq，结合10x Visium和CosMx技术。该研究分析了81个肾脏样本近338600个单细胞/细胞核，旨在揭示健康和疾病状态下肾脏细胞类型和组织结构的复杂性，并识别纤维化微环境在肾病预后中的作用。

当前，scRNA-seq和snRNA-seq已成为获取不同细胞基因表达信息的成熟技术手段。scRNA-seq作为主流检测技术，在免疫细胞和小胶质细胞的检出上具有显著优势。而在某些特殊情况下，如处理脆弱的基质细胞（如肝脏实质细胞、肾足细胞）、较大直径的细胞（如神经元、心肌细胞）、长时间收样周期的临床样本或冻存于-80℃的组织块时，snRNA-seq展现出明显优势。这两者的优势互补，意味着在相同研究课题中，结合应用两种不同技术将更有效地达到研究目的。

在这方面，俄罗斯专享会284推荐利用先进的时空多组学平台，如10x Genomics、Visium CytAssist、MALDI2和Astral，提供单细胞空间多组学的综合解决方案，包括单细胞测序、单细胞蛋白组学、空间转录组、空间蛋白组、深度空间代谢组及常规转录和代谢组检测，积累了丰富的项目经验，助力发表高影响力的研究文章。欢迎与我们联系，共同开展时空多组学联合实验！